Warto pamiętać, że w wykazie zamieszczane są wyłącznie rachunki rozliczeniowe lub imienne rachunki w SKOK, otwarte w związku z prowadzoną działalnością gospodarczą. Jeżeli zatem do działalności gospodarczej podatnik wykorzystuje rachunek oszczędnościowo-rozliczeniowy (tzw. ROR), to taki rachunek nie będzie zamieszczony w wykazie.
Na stronie Ministerstwa Finansów-Krajowej Administracji Skarbowej i napodatki.gov.pl MF prezentuje nowe pytania i odpowiedzi ws. Wykazu podatników VAT, które pomogą podatnikom przygotować się do korzystania z niego. Zostały przygotowane m.in. na bazie pytań wpływających do Krajowej Informacji Skarbowej. Dotyczą one m.in. rachunków wirtualnych kontrahentów, płatności za pomocą karty debetowej, kredytowej lub szybkich płatności internetowych, a także płatności na rzecz zagranicznych kontrahentów, którzy nie są zarejestrowani w Polsce jako czynni podatnicy VAT.