Przyczyny wykreślenia były niejednolite m.in. wyrejestrowano zagraniczne firmy, które długookresowo nie wykonywały żadnej działalności opodatkowanej w Polsce. Ministerstwo Finansów wskazuje, że wśród wykreślonych są firmy, które nie składały deklaracji VAT lub wystawiały tzw. puste faktury dokumentujące fikcyjne transakcje. Fiskus usuwa z rejestru także te firmy, z którymi nie może się skontaktować lub uznał je za nieistniejące. W takiej sytuacji urząd skarbowy nie musi informować o wykreśleniu. Występowały jednak przypadki, gdy firma była usuwana z rejestru tylko dlatego, że urzędnicy nie zastali przedsiębiorcy pod adresem siedziby. Wprowadzenie obowiązku składania pliku JPK także ułatwiło fiskusowi zbieranie danych o firmach i przeprowadzanych transakcjach. Warto wskazać, że od 1 października 2018 r. w formacie JPK będą przesyłane także sprawozdania finansowe.
Wykreślona z rejestru firma, pomimo prowadzenia przez nią działalności gospodarczej, staje się niewiarygodna dla kontrahentów. Problem stanowi także odliczenie VAT z faktury wystawionej przez firmę, którą fiskus usunął z bazy.
Projekt ustawy o zmianie ustawy o podatku od towarów i usług oraz niektórych innych ustaw z dnia 13 lutego 2018 r., skierowany do konsultacji publicznych, przewiduje możliwość wykreślenia z rejestru podatników VAT lub podatników VAT UE, gdy długookresowo będą oni składać deklaracje „zerowe”. Projektowane zmiany wskazują także, że wyłączona zostanie możliwość przywracania zarejestrowania podatnika po upływie dwóch miesięcy od dnia wykreślenia z rejestru w przypadku, gdy nie złożył on deklaracji VAT. Zmiany stanowią także o wyłączeniu możliwości przywracania zarejestrowania podatników wykreślonych z rejestru VAT ze względu na posiadanie informacji wskazujących na prowadzenie przez podatnika działań z zamiarem wykorzystania działalności banków lub SKOK-ów do celów mających związek z wyłudzeniami skarbowymi. Ponadto firmy powinny aktualizować informacje podane fiskusowi dotyczące adresu, numeru telefonu oraz kontaktu e-mailowego.
Istotnym jest, że firma, która chce zostać przywrócona do rejestru VAT może udowodnić dowolnymi sposobami, że prowadzi działalność i doprowadzić tym samym do ponownego umieszczenia jej danych w rejestrze podatników VAT.
Jeśli chcieliby Państwo otrzymać więcej informacji na ten temat zapraszamy do kontaktu.