Z dniem 1 stycznia 2017 roku do ustawy o podatku od towarów i usług¹ wprowadzono kilka zasadniczych zmian. Jedną z nich był sposób rozliczania podatku naliczonego od wewnątrzwspólnotowego nabycia towarów. Podatnik, który chce skorzystać z prawa odliczenia podatku naliczonego w tym samym okresie, w którym zobowiązany jest do rozliczenia podatku należnego, musi zrobić to w terminie trzech miesięcy od dnia powstania obowiązku podatkowego. Późniejsze wykazanie WNT skutkuje obowiązkiem rozliczenia podatku należnego wstecznie poprzez korektę właściwej deklaracji, z jednoczesnym wykazaniem podatku naliczonego na bieżąco. W związku z powyższym, przekroczenie trzymiesięcznego terminu na wykazanie WNT wiąże się z koniecznością zapłaty podatku należnego wraz z odsetkami za zwłokę od dnia wymagalności podatku do dnia jego zapłaty. Przedmiotem poniższego opracowania jest analiza czy przepisy wprowadzone w drodze nowelizacji ustawy są zgodne z Dyrektywą 2006/112/WE² oraz wynikającą z niej zasadą neutralności i proporcjonalności podatku VAT.

Trybunał Sprawiedliwości Unii Europejskiej wiele razy zwracał uwagę w swoim orzecznictwie, że prawo do odliczenia podatku naliczonego, określone w Dyrektywie Rady 2006/112/WE z 28 listopada 2006 r. w sprawie wspólnego systemu podatku od wartości dodanej¹, stanowi integralną część mechanizmu VAT i co do zasady nie podlega ograniczeniu². Minister Finansów RP w odpowiedzi na jedną z interpelacji poselskich wyjaśnia, że niezarejestrowanie dostawcy towaru lub usługodawcy jako podatnika VAT czynnego nie pozbawia nabywcy danego towaru bądź określonej usługi do odliczenia VAT.